MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 62686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022579	TGA	2	6	363	368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593594
2	NC_022579	A	7	7	381	387	100 %	0 %	0 %	0 %	551593594
3	NC_022579	GAA	3	9	470	478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593595
4	NC_022579	A	6	6	492	497	100 %	0 %	0 %	0 %	551593595
5	NC_022579	GAA	2	6	527	532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593595
6	NC_022579	AAAG	2	8	539	546	75 %	0 %	25 %	0 %	551593595
7	NC_022579	CTCAT	2	10	567	576	20 %	40 %	0 %	40 %	551593595
8	NC_022579	GCAG	2	8	581	588	25 %	0 %	50 %	25 %	551593595
9	NC_022579	T	6	6	610	615	0 %	100 %	0 %	0 %	551593595
10	NC_022579	AAT	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593595
11	NC_022579	GAA	2	6	666	671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593595
12	NC_022579	T	6	6	692	697	0 %	100 %	0 %	0 %	551593595
13	NC_022579	TA	3	6	774	779	50 %	50 %	0 %	0 %	551593596
14	NC_022579	GAC	2	6	788	793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593596
15	NC_022579	AGC	2	6	880	885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593596
16	NC_022579	CAG	2	6	973	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593596
17	NC_022579	A	8	8	1182	1189	100 %	0 %	0 %	0 %	551593596
18	NC_022579	A	6	6	1238	1243	100 %	0 %	0 %	0 %	551593596
19	NC_022579	CCA	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593597
20	NC_022579	GAA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593597
21	NC_022579	GAA	2	6	1657	1662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593597
22	NC_022579	TGC	2	6	1701	1706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593597
23	NC_022579	GT	3	6	1733	1738	0 %	50 %	50 %	0 %	551593597
24	NC_022579	T	7	7	1738	1744	0 %	100 %	0 %	0 %	551593597
25	NC_022579	A	6	6	1768	1773	100 %	0 %	0 %	0 %	551593597
26	NC_022579	TAA	2	6	1935	1940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593597
27	NC_022579	ATC	2	6	1945	1950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593597
28	NC_022579	TTAA	2	8	2621	2628	50 %	50 %	0 %	0 %	551593598
29	NC_022579	A	6	6	2635	2640	100 %	0 %	0 %	0 %	551593598
30	NC_022579	TAGG	2	8	2652	2659	25 %	25 %	50 %	0 %	551593598
31	NC_022579	GATTG	2	10	2845	2854	20 %	40 %	40 %	0 %	551593599
32	NC_022579	GAG	2	6	2893	2898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593599
33	NC_022579	TCCA	2	8	2916	2923	25 %	25 %	0 %	50 %	551593599
34	NC_022579	GTTA	2	8	2929	2936	25 %	50 %	25 %	0 %	551593599
35	NC_022579	TTCA	2	8	2958	2965	25 %	50 %	0 %	25 %	551593599
36	NC_022579	TGA	2	6	3071	3076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
37	NC_022579	TAA	2	6	3101	3106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593600
38	NC_022579	A	8	8	3105	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	551593600
39	NC_022579	TGT	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593600
40	NC_022579	A	7	7	3181	3187	100 %	0 %	0 %	0 %	551593600
41	NC_022579	ATT	2	6	3209	3214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593600
42	NC_022579	TGA	3	9	3306	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
43	NC_022579	TGA	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
44	NC_022579	GAAA	2	8	3468	3475	75 %	0 %	25 %	0 %	551593600
45	NC_022579	GAA	2	6	3505	3510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593600
46	NC_022579	AAG	2	6	3571	3576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593600
47	NC_022579	TCT	2	6	3589	3594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593600
48	NC_022579	ATA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593600
49	NC_022579	AGA	2	6	3777	3782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593600
50	NC_022579	A	7	7	3863	3869	100 %	0 %	0 %	0 %	551593600
51	NC_022579	AGC	2	6	3876	3881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593600
52	NC_022579	ATG	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
53	NC_022579	CAT	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593600
54	NC_022579	TTCAG	2	10	4147	4156	20 %	40 %	20 %	20 %	551593600
55	NC_022579	AAC	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593600
56	NC_022579	CTC	2	6	4262	4267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593600
57	NC_022579	TGA	2	6	4275	4280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
58	NC_022579	GAAT	2	8	4338	4345	50 %	25 %	25 %	0 %	551593600
59	NC_022579	TGA	2	6	4446	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
60	NC_022579	A	6	6	4473	4478	100 %	0 %	0 %	0 %	551593600
61	NC_022579	AAT	2	6	4612	4617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593600
62	NC_022579	GAT	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
63	NC_022579	A	6	6	4711	4716	100 %	0 %	0 %	0 %	551593600
64	NC_022579	GAT	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
65	NC_022579	CCAA	2	8	4803	4810	50 %	0 %	0 %	50 %	551593600
66	NC_022579	GAT	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593600
67	NC_022579	T	6	6	4858	4863	0 %	100 %	0 %	0 %	551593600
68	NC_022579	AAC	2	6	4910	4915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593600
69	NC_022579	T	6	6	5014	5019	0 %	100 %	0 %	0 %	551593600
70	NC_022579	TGTC	2	8	5047	5054	0 %	50 %	25 %	25 %	551593600
71	NC_022579	CAA	2	6	5126	5131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593600
72	NC_022579	AAT	2	6	5179	5184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593600
73	NC_022579	ATTT	2	8	5203	5210	25 %	75 %	0 %	0 %	551593600
74	NC_022579	GAC	2	6	5373	5378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593600
75	NC_022579	TTC	2	6	5393	5398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593600
76	NC_022579	AGA	2	6	5399	5404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593600
77	NC_022579	AG	3	6	5407	5412	50 %	0 %	50 %	0 %	551593600
78	NC_022579	CAG	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593600
79	NC_022579	GGA	2	6	5613	5618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593601
80	NC_022579	CTG	2	6	5626	5631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593601
81	NC_022579	GAA	2	6	5721	5726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593601
82	NC_022579	CCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593601
83	NC_022579	GAA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593601
84	NC_022579	CTTT	2	8	6000	6007	0 %	75 %	0 %	25 %	551593601
85	NC_022579	CTTT	2	8	6017	6024	0 %	75 %	0 %	25 %	551593601
86	NC_022579	GCA	2	6	6029	6034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593601
87	NC_022579	TCA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593601
88	NC_022579	A	6	6	6076	6081	100 %	0 %	0 %	0 %	551593601
89	NC_022579	TTC	2	6	6303	6308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593602
90	NC_022579	T	7	7	6314	6320	0 %	100 %	0 %	0 %	551593602
91	NC_022579	CAA	2	6	6403	6408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593602
92	NC_022579	TCC	2	6	6453	6458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593602
93	NC_022579	ATCTA	2	10	6482	6491	40 %	40 %	0 %	20 %	551593602
94	NC_022579	AAAAT	2	10	6624	6633	80 %	20 %	0 %	0 %	551593602
95	NC_022579	GCC	2	6	6693	6698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593602
96	NC_022579	TCTG	2	8	6730	6737	0 %	50 %	25 %	25 %	551593602
97	NC_022579	GGAT	2	8	6837	6844	25 %	25 %	50 %	0 %	551593602
98	NC_022579	TTG	2	6	6873	6878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593602
99	NC_022579	TCT	2	6	7018	7023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593602
100	NC_022579	CCT	2	6	7063	7068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593602
101	NC_022579	CCAGC	2	10	7092	7101	20 %	0 %	20 %	60 %	551593602
102	NC_022579	CCG	2	6	7169	7174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593602
103	NC_022579	GAAC	2	8	7223	7230	50 %	0 %	25 %	25 %	551593603
104	NC_022579	GCG	2	6	7255	7260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593603
105	NC_022579	TCC	2	6	7265	7270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593603
106	NC_022579	TCA	3	9	7301	7309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593603
107	NC_022579	GAC	2	6	7338	7343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593603
108	NC_022579	AAG	2	6	7363	7368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593603
109	NC_022579	CTG	2	6	7381	7386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593603
110	NC_022579	CTGAT	2	10	7472	7481	20 %	40 %	20 %	20 %	551593603
111	NC_022579	CTT	2	6	7519	7524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593603
112	NC_022579	GCAA	2	8	7647	7654	50 %	0 %	25 %	25 %	551593604
113	NC_022579	GTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593604
114	NC_022579	CAC	2	6	7741	7746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593604
115	NC_022579	AGG	2	6	7754	7759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593604
116	NC_022579	GCA	2	6	7908	7913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593604
117	NC_022579	GCTTT	2	10	7939	7948	0 %	60 %	20 %	20 %	551593604
118	NC_022579	GGT	2	6	7977	7982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593604
119	NC_022579	AATTT	2	10	8025	8034	40 %	60 %	0 %	0 %	551593604
120	NC_022579	CTT	2	6	8048	8053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593604
121	NC_022579	T	6	6	8231	8236	0 %	100 %	0 %	0 %	551593604
122	NC_022579	T	6	6	8330	8335	0 %	100 %	0 %	0 %	551593604
123	NC_022579	TCA	2	6	8338	8343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593604
124	NC_022579	TGATG	2	10	8942	8951	20 %	40 %	40 %	0 %	551593605
125	NC_022579	ACTC	2	8	8956	8963	25 %	25 %	0 %	50 %	551593605
126	NC_022579	GCA	2	6	9001	9006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593605
127	NC_022579	GAGC	2	8	9007	9014	25 %	0 %	50 %	25 %	551593605
128	NC_022579	ATT	2	6	9022	9027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593605
129	NC_022579	TGATA	2	10	9258	9267	40 %	40 %	20 %	0 %	551593606
130	NC_022579	GC	3	6	9333	9338	0 %	0 %	50 %	50 %	551593606
131	NC_022579	GTG	2	6	9353	9358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593606
132	NC_022579	AGT	2	6	9424	9429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593606
133	NC_022579	AAC	2	6	9447	9452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593606
134	NC_022579	ATG	2	6	9455	9460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593606
135	NC_022579	AGC	2	6	9498	9503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593606
136	NC_022579	ATT	2	6	9518	9523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593606
137	NC_022579	AGC	3	9	9560	9568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593606
138	NC_022579	ATA	2	6	9614	9619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593606
139	NC_022579	A	6	6	9654	9659	100 %	0 %	0 %	0 %	551593606
140	NC_022579	GTT	2	6	9673	9678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593606
141	NC_022579	ATG	2	6	9698	9703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593606
142	NC_022579	TCA	3	9	9792	9800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593606
143	NC_022579	ATG	2	6	9824	9829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593606
144	NC_022579	TTTA	2	8	9902	9909	25 %	75 %	0 %	0 %	551593606
145	NC_022579	AT	3	6	9915	9920	50 %	50 %	0 %	0 %	551593606
146	NC_022579	TTG	2	6	9949	9954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593606
147	NC_022579	TGA	2	6	9966	9971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593606
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149	NC_022579	TA	3	6	9997	10002	50 %	50 %	0 %	0 %	551593606
150	NC_022579	TTG	2	6	10039	10044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593606
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152	NC_022579	TAAT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	551593606
153	NC_022579	ATT	2	6	10268	10273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593606
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156	NC_022579	CTGG	2	8	10645	10652	0 %	25 %	50 %	25 %	551593607
157	NC_022579	TTG	2	6	10667	10672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593607
158	NC_022579	A	6	6	10721	10726	100 %	0 %	0 %	0 %	551593608
159	NC_022579	TAA	2	6	10727	10732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593608
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162	NC_022579	GA	3	6	10852	10857	50 %	0 %	50 %	0 %	551593608
163	NC_022579	GCT	2	6	10864	10869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593608
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175	NC_022579	A	6	6	12021	12026	100 %	0 %	0 %	0 %	551593610
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178	NC_022579	GACA	2	8	12051	12058	50 %	0 %	25 %	25 %	551593610
179	NC_022579	A	6	6	12342	12347	100 %	0 %	0 %	0 %	551593610
180	NC_022579	A	6	6	12362	12367	100 %	0 %	0 %	0 %	551593610
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242	NC_022579	GGAT	2	8	15335	15342	25 %	25 %	50 %	0 %	551593614
243	NC_022579	TGA	2	6	15401	15406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593614
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249	NC_022579	GAA	2	6	15792	15797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593614
250	NC_022579	GTT	2	6	15819	15824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593614
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252	NC_022579	ACA	2	6	15907	15912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593615
253	NC_022579	ATA	2	6	15930	15935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593615
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256	NC_022579	TA	3	6	15989	15994	50 %	50 %	0 %	0 %	551593615
257	NC_022579	T	6	6	15999	16004	0 %	100 %	0 %	0 %	551593615
258	NC_022579	CCT	2	6	16042	16047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593615
259	NC_022579	GCTT	2	8	16062	16069	0 %	50 %	25 %	25 %	551593615
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261	NC_022579	TTC	2	6	16151	16156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593615
262	NC_022579	T	6	6	16162	16167	0 %	100 %	0 %	0 %	551593615
263	NC_022579	TC	3	6	16206	16211	0 %	50 %	0 %	50 %	551593615
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266	NC_022579	TCT	2	6	16317	16322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593615
267	NC_022579	T	6	6	16373	16378	0 %	100 %	0 %	0 %	551593616
268	NC_022579	ATT	2	6	16497	16502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593616
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497	NC_022579	T	6	6	31004	31009	0 %	100 %	0 %	0 %	551593636
498	NC_022579	CATAT	2	10	31013	31022	40 %	40 %	0 %	20 %	551593636
499	NC_022579	GCC	2	6	31053	31058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593636
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